晒种能促进种子后熟，增强种子内酶的活性，提高种胚的生活力，加强种皮的透性和种子的吸水能力，从而提高发芽率和发芽出苗速度。由于转基因抗虫棉的种子一般休眠期较长，而打破种子休眠期方便、有效的办法就是播前晒种。晒种的时间，一般在播种前选晴好天气连续晒种２～４天，毛子晒种时间可长些，晒至种子摇动有响声为准。
晒种时不宜在石板或水泥地上进行，以免晒伤种子或个别种子形成硬子不易出苗。可将棉种摊在竹席或布单上暴晒。种子不要摊得太厚，一般１０厘米左右即可，每天翻３～５次，保证晒匀、晒透。
结合晒种可对棉种进行粒选，把小子、秕子、绿毛子、大白子、畸形子和破子等杂种或劣种剔除掉，留下成熟饱满、符合本品种特征的正常棉子作种用。通过粒选也可以提高棉种的纯度。
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